北京基因组所(国家生物信息中心)合作揭示m5C调控Th17细胞命运及结肠炎发生机制

  辅助性T细胞17Th17细胞)是CD4+ T细胞的主要亚群之一,对自身炎症免疫应答至关重要。Th17细胞受其谱系特异性转录因子RoRγt调控,表达和分泌炎症相关细胞因子,如IL-17AIL-17F等,参与结肠炎、系统性红斑狼疮、硬皮病、银屑病和类风湿性关节炎等自身免疫性疾病。近年来,研究报道DNA甲基化和组蛋白修饰等表观遗传因素参与调控Th17细胞分化过程,然而,RNA甲基化修饰是否调控Th17细胞功能目前仍不清楚。 

  近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)杨运桂、杨莹,中国科学院生物物理研究所杨鹏远和中国科学院动物研究所李伟以共同通讯作者在Nature Communications杂志上发表了题为Nsun2 coupling with RoRγt shapes the fate of Th17 cells and promotes colitis的研究论文。阐明了小鼠CD4+ T细胞中RNA 5-甲基胞嘧啶(m5C)甲基转移酶Nsun2缺失特异性抑制Th17细胞分化,并减轻Th17细胞诱导的结肠炎发生的功能机制,为自身免疫性疾病治疗提供了潜在靶点。 

  在本研究中,合作团队观察到Nsun2在小鼠胸腺、淋巴结和脾脏等免疫器官,尤其是Th17细胞中的高表达。通过构建T细胞条件性敲除Nsun2小鼠(Nsun2f/f: Cd4-Cre+/-),发现Nsun2缺陷特异性抑制了Th17细胞分化,但不影响其它免疫细胞亚群。Nsun2Th17细胞关键转录因子RoRγt直接作用,但不影响Th17细胞的染色质开放性和新生RNA生成。通过进一步机制解析,发现RoRγt募集Nsun2到其靶标基因Th17细胞特异性细胞因子的染色质区域,通过转录偶联催化m5C,其中包括Il17aIl17f。通过分别在Nsun2缺失的nave CD4+ T细胞中进行回补野生型(Nsun2-WT)和m5C催化酶酶活位点突变体(Nsun2-C321A,发现Nsun2介导的m5C修饰调控了Th17细胞的稳态并增强了Il17aIl17f mRNA的稳定性。 

  通过构建葡聚糖硫酸钠盐(Dextran Sulfate Sodium Salt, DSS)诱导和CD4+CD25-CD45RBhi T细胞过继性两种小鼠结肠炎模型,发现Nsun2缺失可减轻Th17细胞诱导的结肠炎进展,并且该表型能够通过回补Nsun2的靶标基因产物IL-17A/IL-17F蛋白逆转。通过在DSS诱导结肠炎的单细胞转录组测序分析,发现Nsun2缺失破坏了Th17细胞与IL-17受体细胞之间的细胞间通讯平衡,抑制了结肠炎的进程。 

  综上所述,该研究解析了Th17细胞中RoRγt偶联Nsun2,特异性催化Th17细胞关键细胞因子转录本上m5C修饰的形成,促进其靶基因mRNA的稳定性,为Th17细胞诱导的肠炎等自身免疫疾病机制提供研究线索。

  该研究得到了来自科技部、国家自然科学基金委和中国科学院等项目的资助。

m5C甲基转移酶Nsun2缺失减轻了肠炎的发生

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