3月9日，中国科学院北京基因组研究所召开首届职工大会，所领导班子成员、第一届工会（职代会）职工代表、各项目组与平台的PI、中级职称以上科研人员、各职能部门人员等百余人参加了大会，大会由所工会主席肖景发同志主持。

吴仲义所长首先作了题为“我们未来三年的机遇、选择与策略”的工作报告，从机遇、选择、策略三个层面畅谈了研究所未来的发展方向。他指出：基因组学已经进入了科学假说驱动的新时代，大规模基因组测序是生物学发展以来的重大突破，使我们能够有机会解决过去很多悬而未决的问题。基因组所也因此启动了肿瘤基因组学研究，畜养动植物基因组学研究及人类基因组变异研究等一系列研究项目。目前，与芝加哥大学及Life Technology (SOLiD测序仪)形成一个初步合作协议，即成立肿瘤基因组研究的战略联盟，力争在三年内将中国肿瘤基因组学带到国际领先的地位。最后，吴仲义所长表示，生物研究革命已悄悄来临，我们已经做好了各方面准备，共同迎来研究所的新发展。

接着，于军副所长介绍了研究所开展第三代测序仪研发项目的进展情况及重要科学意义，汇报了正在进行的国际合作项目——“中沙椰枣基因组计划项目”的进展情况。韩斌副所长介绍了水稻基因组研究项目进展情况，并详尽的汇报了在水稻基因组学研究方面国内外的基本状况、技术方法和发展趋势等。

党委书记、常务副所长杨卫平作了题为：“基因组所2009年度运行情况、财务和基建工作报告”，报告分为三部分。首先向全体参会人员发放了“2009年度研究所运行情况简表”，采用图文并茂的方式，逐一对工作简表中的研究所各机构人员状况、科研项目进展情况、经费使用情况、成果与贡献等项工作，用直观的图表数据进行了详细全面的总结。其次，介绍了研究所永久所址基建工作方面的进展情况和下一步工作目标，从四个方面认真抓好落实，即立项启动、工艺设计、形成决策机制和做出工作计划。根据研究所的特点，制订了科学严谨的《基因组学实验楼设计工艺要求书》为今后的总体设计和施工工作打下良好的基础。建立科学、高效的决策机制，成立了研究所基建工作小组，以“基建工作简报”的方式推进基建工作扎实的开展与落实。最后介绍了研究所2009年财务决算情况，对2010年财务预算情况作了详细的分析和展望。杨书记指出：研究所工作已经走向正轨，但未来压力与挑战并存，需要大家更加不懈的团结和努力，为研究所的发展贡献应有的力量。

大会的最后，所工会向参加大会的职工发放了“研究所发展意见征集表”，征集大家对研究所发展的建议和意见，使每位职工都能为研究所的发展献计献策，为建设一个高效、和谐、奋进的研究所而共同努力。