宋述慧（Shuhui Song）----中国科学院北京基因组研究所

副研究员，中科院北京基因组所博士

Email：songshh@big.ac.cn

教育及工作经历：

2010年10月---至今中国科学院北京基因组研究所副研究员

2008年4月---2010年10 中国科学院北京基因组研究所助理研究员

2003年9月---2008年1月中国科学院北京基因组研究所遗传学博士

1999年9月---2003年7月山西师范大学生物学学士

专业工作（包括研究方向）：

宋述慧博士从2003年以来一直从事基因组学与生物信息学相关的科研工作，主要研究方向是转录组学的方法研究和在转录组水平上研究水稻杂种优势的分子机理。目前主要的研究工作有：（1）通过大规模组学数据的分析，从转录调控方面研究水稻杂种优势的分子机理；（2）基于高通量测序数据分析算法、相关应用软件及数据库的开发与维护。

拟招收学生的背景：

2012年拟招收1名硕士，欢迎生物学、数理统计、计算机、与生物信息学等背景的学生报名

主要成果（发表论文、专利等）

1. Song S.H., Qu H.Z., Chen C., Hu S.N., Yu J. Differential gene expression in an elite hybrid rice cultivar (Oryza sativa, L) and its parental lines based on SAGE data. BMC Plant Biology 2007 Sep 19; 7 (1):49. IF：3.23

2. Song S.H., Huang Y.F., Wang X., Wei G., Qu H.Z., Wang W.W., Ge X.M., Hu S.N., Guozhen Liu1,Liang Y.C., Yu J. HRGD: a Database for mining potential heterosis-related genes in plants. Plant Molecular Biology. 10.1007/s11103-008-9421-6, IF: 3.847

3. Zhao D.X., Song S.H.^*, Wang Q., Zhang X.W., Hu S.N, Chen L.Q. Discovery of immune-related genes in Chinese mitten crab (Eriocheir sinensis) by expressed sequence tag analysis of haemocytes. Aquaculture. IF: 1.735 （并列第一作者）

4.Xu X.Q., Song S.H, Wang Q., Qin F., LiuK., Zhang X.W., Hu S.N., Zhao Y.L. Analysis and comparison of a set of expressed sequence tags of the parthenogenetic water flea Daphnia carinata Molecular Genetics and Genomics. 2009,　 IF:2.978 （并列第一作者）

5. Zhu J., He F.H., Song S.H., Wang J., Yu J. How many human genes can be defined as housekeeping with current expression data? BMC Genomics 2008, 9:172. IF: 4.18

6. Wang W.W., Meng B., Ge X.M., Song S.S., Yang Y., Yu X.M., Wang L.G., Hu S.N., Liu S.Q., Yu J. Proteomic Profiling of Rice Embryos from a Hybrid Rice Cultivar and Its Parental Lines. Proteomics，2008, 8(22):4808-4821. IF: 5.479

7. Ge X.M., Chen W.H., Song S.H., Wang W.W., Hu S.N., Yu J. Transcriptomic profiling of mature embryo from an elite super-hybrid rice LYP9 and its parental lines BMC Plant Biology.2008, 8:114. IF：3.23

8. Yang M., Song S.H., Liu G.M., Chen K. F., Tian X. J., Zhao Z. Z. J, Hu S.N., Yu J. A comprehensive analysis of protein phosphatases in rice and Arabidopsis Plant Syst Evol. 2010, 289:111–126 IF:1.41

9. Hao Y, Huang D, Guo H, Xiao M, An H, Zhao L, Zuo F, Zhang B, Hu S, Song S, Chen S, Ren F. Complete Genome Sequence of Bifidobacterium longum subsp. longum BBMN68, a New Strain from Healthy Chinese Centenarian. J Bacteriol.2010 Nov 19. IF: 3.94

10. Wanfei Liu1, 2, Dawei Huang1, 2, Kan Liu1, 2, Songnian Hu1, JunYu1, Gao Gang3*, Shuhui Song1* Discovery, identification and comparative analysis of Solanaceae non-specific lipid transfer protein (nsLtp) gene family GPB 2010 (通讯作者）

11. J Yuan, W Liu, M Sun, S Song, J Cai and S Hu Complete Genome Sequence of Pathogenic Bacterium Riemerella anatipestifer Strain RA-GD. J Bacteriol. 2011 IF: 3.94

12. W Zhao1*, W Liu1, 2*, D Tian1*, B Tang1*, Y Wang1, C Yu1, R Li1, Y Ling1, 2, JWu1, S Song1# and S Hu1# wapRNA: a web-based application for the processing of RNA sequences Bioinformatics. 2011 IF:4.877 (通讯作者）

主要成果（数据库资源共享）

杂种优势潜在相关基因数据HRGD：http://hrgd.big.ac.cn/

RNA-seq在线分析工具WAP-RNA: http://waprna.big.ac.cn/