获奖时间	获奖名称	获奖类别	获奖等级
2018	基于新一代测序技术的法医基因组学研究	2018年中国分析测试协会科学技术奖（CAIA奖）	二等奖
2018年	血液系统恶性肿瘤发生、进展核心机制研究及分子靶向策略探讨	湖北省科学技术奖励	一等奖
2018	第十一届谈家桢生命科学创新奖
2015	天津市自然科学奖一等奖
2015	第十五届李汝祺动物遗传奖
2013	中国专利优秀奖	国家	国家
2012	2012年度发展中国家科学院农业奖	国际	国际
2009.12	“超级杂交水稻杂种优势相关的潜在功能基因的发掘与鉴定”--2009中国基础研究十大新闻
2007.12	“证实CASP8基因启动子的一个六核苷酸插入/缺失多态与多种癌症易感性相关”-2007年度中国基础研究十大新闻
2004-3	中国杂交水稻基因组计划--中国科学院杰出科技成就奖	科技成就奖	集体奖
2003	“中国科学院防治非典工作先进基层党组织” 称号	其他	集体奖
2004.7	SARS病源的发现与确证--军队科技进步奖二等奖（第二完成单位）	科技进步奖	集体奖
2005.2	非典型肺炎冠状病毒基因组测序及ELISA诊断试剂盒研究---北京市科技进步奖	科技进步奖	二等奖
2003-3	中国杂交水稻基因组计划--中国科学院2001-2002年度重大创新贡献团队	其他	集体奖
2003	抗击非典研究系列研究--首都劳动奖状	其他	集体奖
2002.9	完成水稻基因组和建立中国基因组分析基地--求是杰出科技成就奖	科技成就奖	集体奖
2005	2005“北京十大杰出青年”-邓亚军	其他	个人奖
2003	“中国科学院防治非典型肺炎工作优秀共产党员”-文洁	其他	个人奖
2003	“首都防治非典型肺炎工作先进个人”-汪建	其他	个人奖
2003	中国科学院北京赴泰国-DNA检测救援小组 ---首都劳动奖状	其他	集体奖